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時序數(shù)據庫連載系列:Berkeley 的黑科技 BTrDB

來源:焦先 發(fā)布時間:2019-02-23 16:56:33 閱讀量:1044

本文是對面向 IoT 領域的開源時序數(shù)據庫 BTrDB 內部實現(xiàn)細節(jié)的研究和介紹。

1. 場景介紹

BTrDB 論文中介紹了一個實際的項目,能很好解釋清楚 BTrDB 的設計初衷和適用場景:

在一個電網中大量部署了某類傳感器,每個傳感器會產生 12 條時間線,每條時間線頻率為 120Hz(即每秒 120 個點),時間精度為 100ns;由于各種原因,傳感器數(shù)據傳輸經常性出現(xiàn)延遲、(時間)亂序等。BTrDB 在該場景下單機能支撐 1000 個類似的傳感器,寫入速率約 1.44M points/s。

該項目有這樣幾個特點:
1. 時間線在很長時間內有一定的不變性,其生命周期跟(IoT)設備周期一致
2. 數(shù)據頻率很高(120 Hz)且固定
3. 數(shù)據的時間分辨率很高(100ns級別),一般如Druid,TimescaleDB 時間精度最多做到 ms 級別
4. 數(shù)據傳輸經常性出現(xiàn)亂序
5. 時間線數(shù)量有限

BTrDB 為了適應上述場景,設計并提出了 "time-partitioning version-annotated copy-on-write tree" 的數(shù)據結構,為每一條時間線構建了一棵樹(可以參考B+Tree),數(shù)據在該樹中按照時間戳排序,葉子節(jié)點有序得存放某個時間段內的時序數(shù)據。
可以想見,這棵樹的生命周期跟設備的生命周期直接掛鉤,因此隨著時間的發(fā)展,這棵樹即使只包含一條時間線,也會占用很可觀的存儲空間(約 10M points/day);另外由于是基于樹結構,并且引入了版本(version-annotated) 的概念,BTrDB 可以很好的支持亂序數(shù)據和任意精度的時序數(shù)據。

由于數(shù)據結構不同于以往時序數(shù)據庫基于LSM-Tree的變種,因此 BTrDB 還提供了一套新的時序數(shù)據查詢接口,方便在 BTrDB 上層構建各種算法和應用。

2. 數(shù)據結構

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2.1 version-annotated & CoW 特性

在數(shù)據寫入時,BTrDB 會先修改在內存中的數(shù)據塊(新建或者使用 CoW 機制修改已有塊),當數(shù)據達到一定閾值時再寫回底層塊存儲;由于 CoW 機制,并且底層塊存儲(默認使用Ceph)無法覆蓋更新,因此只能創(chuàng)建一個新版本的數(shù)據塊。

2.2. 葉子節(jié)點

對于 IoT 設備發(fā)來的數(shù)據,由于頻率固定,這些葉子節(jié)點占用空間大小基本一致。

葉子節(jié)點還未持久化到底層存儲時,在內存中通過數(shù)組的方式分別存放時間戳和(雙精度浮點)值;在序列化到底層存儲時,會通過delta-delta的方式壓縮時間戳和值;在序列化雙精度浮點數(shù)值之前,會將浮點數(shù)據數(shù)拆分為尾數(shù)和指數(shù)兩部分,并分別進行delta-delta壓縮。

2.3. 中間節(jié)點:

中間節(jié)點被劃分為多個 bucket,每個 bucket 中存放著指向子節(jié)點的鏈接(帶版本號)以及子節(jié)點的統(tǒng)計數(shù)據:

  • 子節(jié)點的時間范圍

  • 聚合數(shù)據,如 sum, max, min,count 等

  • 子節(jié)點連接地址和版本號

在處理查詢時,如果中間節(jié)點的時間精度滿足查詢需求,查詢操作就不再讀取下層子節(jié)點了,這樣就很自然的實現(xiàn)了將精度功能;這種實現(xiàn)方式,能夠很好的處理亂序、重復數(shù)據以及刪除操作,并且與其他現(xiàn)有的實現(xiàn)相比,能夠很好的保證數(shù)據的一致性。

2.4. 插入時樹的分裂

一棵新的樹(對應一條新的時間線)只有一個根節(jié)點,在 BTrDB 的實現(xiàn)中,根節(jié)點時間跨度約為146.23年,這樣每個 bucket 的時間跨度為 146.23/64 ~= 2.28 (年),根據默認配置,1970年在根節(jié)點的第16個 bucket。

可見,根節(jié)點在創(chuàng)建時就已經限制了數(shù)據的時間范圍,后續(xù)數(shù)據的插入是自頂向下逐層分裂的,當數(shù)據因為丟失等原因造成時間線不完整時,部分節(jié)點的深度可能會不一樣,因此并不是一顆嚴格的平衡樹。數(shù)據插入過程如下:

  • 數(shù)據插入操作從根節(jié)點開始;

  • 如果當前節(jié)點是中間節(jié)點,則遍歷每個數(shù)據,為每個數(shù)據找到對應的 bucket;

  • 如果對應的 bucket 不存在,則創(chuàng)建新的 bucket 和與該 bucket 關聯(lián)的子節(jié)點:

    • 如果當前 bucket 待插入的點個數(shù)超過葉子節(jié)點最大點數(shù)(默認1024),則直接創(chuàng)建中間子節(jié)點;

    • 否則,創(chuàng)建葉子節(jié)點;

  • 將數(shù)據插入到與所屬 bucket 關聯(lián)的子節(jié)點中;

  • 如果當前節(jié)點是葉子節(jié)點,節(jié)點中數(shù)據個數(shù)和待插入數(shù)據個數(shù)總合超過 1024 個點,則分裂當前節(jié)點創(chuàng)建出新的中間節(jié)點,將數(shù)據插入新的中間節(jié)點;否則將待插入數(shù)據和當前節(jié)點已有數(shù)據合并,并按照時間戳排序;

  • 當前節(jié)點插入成功后,自底向上更新父節(jié)點的統(tǒng)計信息;

從上面過程可以看到,節(jié)點在插入時在兩個地方可能出現(xiàn)分裂。一個是從根節(jié)點開始,自頂向下分裂;另一個是從葉子節(jié)點開始,向上分裂。

雖然這棵樹并不是一顆平衡樹,但是對于 IoT 類項目,設備的時間線生命周期、數(shù)據采集頻率很穩(wěn)定,在絕大多數(shù)場景下,節(jié)點中數(shù)據都是均衡分布的。

2.5 節(jié)點占用的內存空間

在默認實現(xiàn)中,葉子節(jié)點中最多存儲1024個數(shù)據點;中間節(jié)點中最多存儲64個子節(jié)點指針,因此:

  • 對于還未持久化的葉子節(jié)點,占用的內存空間為:1024*2*8 = 16K(見 2.2.1)

  • 對于還未持久化的中間節(jié)點,占用的內存為:64*6*8 + 64*2*8 = 4K(見 2.2.2)

3. 數(shù)據存儲相關

3.1 寫 WAL

  • 在數(shù)據插入時,會先將數(shù)據寫入到 WAL(Write Ahead Log) 中;

  • 每次寫 WAL 都會返回一個check point,代表數(shù)據在WAL中的寫入位置;

  • WAL 寫入成功后,原始數(shù)據和 check point 會被寫入時間線的緩沖區(qū);

  • 時間線的緩沖與時間線一一對應,最大容納32768個數(shù)據點;

  • 當緩沖區(qū)滿時,數(shù)據會被插入到樹結構中,并將該緩沖區(qū)對應的 check points 在 WAL 中標記為刪除狀態(tài);

  • 在 WAL 的 replay 過程中會根據已被刪除的 check points 過濾原始數(shù)據。

下面的示意圖展示了WAL中 check points 與時間序列緩沖區(qū)的關聯(lián)關系,在緩沖區(qū)清空后,BTrDB 會將已經刪除的 check points 寫入到當前 WAL 對應的塊文件的元信息(block attributes)中:

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當一個 WAL 塊文件中所有的 check points 都標記為已刪除時,該文件就可以從 Ceph 中刪除了。當前 WAL 文件大小超過16M時就會創(chuàng)建新的塊文件,在理想情況下,塊文件都能被及時刪除;但是如果某些時間線出現(xiàn)異常,向前文提到的,其緩沖區(qū)在 8 小時后才能被回收,那么負責記錄這些時間線的 WAL 文件也就只能在8小時后被回收。
這些滯留的 WAL 文件大小只有16M,數(shù)量與出現(xiàn)異常的 IoT 設備數(shù)量成線性關系,因此需要更多 IoT 設備運行統(tǒng)計數(shù)據才能統(tǒng)計其影響。

3.2 寫 Block

BTrDB 的樹結構在持久化后會產生兩類數(shù)據,一個稱為 superblock,記錄了當前樹的最新版本、更新時間、根節(jié)點位置等基本信息;另外一個稱為 segment,統(tǒng)一包含了樹的葉子節(jié)點和中間節(jié)點的數(shù)據。

superblock 是帶版本的,每個版本的 superblock 只占用16Byte,格式為:

{root: 根節(jié)點位置,8Byte, timestamp: 修改時間,8Byte}

superblock 在 Ceph 中的尋址方式為:

塊存儲 id = uuid.toString() + (version >> 20)
塊存儲中的 offset = (version & 0xFFFFF)*16

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在 BTrDB 中持久化樹結構時葉子節(jié)點和中間節(jié)點會一并序列化到 segment 中,每個節(jié)點的尋址編碼方式為:

塊存儲的 id = uuid.toString() + (address >> 24)
節(jié)點在塊存儲中的偏移量 = (address & 0xFFFFFF)

可以看到, WAL 文件, superblock 塊文件以及 segment 塊文件大小都是 16M。另外,BTrDB 中沒有 compaction,也沒有對過期版本數(shù)據的清理,只有上文中介紹的對 WAL 的處理,寫入放大會很明顯。

新的查詢語義

這里只是羅列、簡單介紹下 BTrDB 提供的新的查詢語義,這些查詢語義的提出與 BTrDB 的數(shù)據結構有很大關系,或者是為了利用樹結構某些特性,或者是為了規(guī)避樹結構一些不足:

  • GetRange(UUID, StartTime, EndTime, Version) → (Version, [(Time, Value)]) 查詢時間線在某個時間范圍內的詳細(原始)數(shù)據;

  • GetLatestVersion(UUID) → Version 查詢時間線最新版本;

  • GetStatisticalRange(UUID, StartTime, EndTime, Version, Resolution) → (Version, [(Time, Min, Mean, Max, Count)]) 獲取給定時間范圍內,滿足一定時間精度的,大于等于給定版本的時間線的聚合數(shù)據;

  • GetNearestValue(UUID, Time, Version, Direction) → (Version, (Time, Value)) 向前、向后獲取下一個點;

  • ComputeDiff(UUID, FromVersion, ToVersion, Resolution) → [(StartTime, EndTime)] 在滿足給定時間精度條件下,獲取兩個版本號范圍內,所有更新節(jié)點的起止時間;適合做增量計算。

上面接口中的時間分辨率參數(shù)(Resolution),對于接口的性能有很大影響。前文提到根節(jié)點的時間分辨率是2.2年,從樹的根節(jié)點到底層節(jié)點,節(jié)點中數(shù)據的時間分辨率越來越高;在查詢時,低分辨率數(shù)據聚合程度高,掃面的數(shù)據塊少;高分辨率的數(shù)據聚合程度低,但是需要掃面的數(shù)據塊很多。

總結

BTrDB 中數(shù)據結構是針對單條時間線構建的,并且針對 IoT 設備數(shù)據穩(wěn)定的特點,構建了一棵樹來存儲時序數(shù)據;樹結構解決了傳統(tǒng) TSDB 在亂序插入、刪除、預降精度等方面面臨的問題。


標簽: 數(shù)據庫
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